Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nf1Q04690 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nf1Q04690 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nf1Q04690 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nf1Q04690 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nf1Q04690 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nf1Q04690 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nf1Q04690 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nf1Q04690 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nf1Q04690 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nf1Q04690 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nf1Q04690 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nf1Q04690 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nf1Q04690 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nf1Q04690 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nf1Q04690 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nf1Q04690 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nf1Q04690 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nf1Q04690 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Nf1Q04690 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nf1Q04690 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nf1Q04690 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nf1Q04690 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nf1Q04690 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nf1Q04690 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nf1Q04690 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nf1Q04690 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nf1Q04690 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nf1Q04690 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nf1Q04690 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nf1Q04690 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nf1Q04690 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nf1Q04690 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nf1Q04690 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nf1Q04690 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Nf1Q04690 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Nf1Q04690 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Nf1Q04690 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nf1Q04690 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nf1Q04690 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nf1Q04690 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nf1Q04690 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nf1Q04690 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nf1Q04690 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nf1Q04690 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Nf1Q04690 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Nf1Q04690 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nf1Q04690 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nf1Q04690 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nf1Q04690 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nf1Q04690 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nf1Q04690 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nf1Q04690 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nf1Q04690 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nf1Q04690 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nf1Q04690 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nf1Q04690 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Nf1Q04690 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Nf1Q04690 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nf1Q04690 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nf1Q04690 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Nf1Q04690 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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