Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RelaQ04207 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RelaQ04207 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RelaQ04207 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RelaQ04207 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RelaQ04207 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RelaQ04207 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RelaQ04207 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RelaQ04207 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RelaQ04207 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RelaQ04207 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RelaQ04207 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RelaQ04207 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RelaQ04207 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RelaQ04207 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RelaQ04207 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RelaQ04207 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RelaQ04207 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RelaQ04207 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RelaQ04207 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RelaQ04207 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RelaQ04207 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RelaQ04207 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RelaQ04207 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RelaQ04207 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RelaQ04207 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RelaQ04207 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RelaQ04207 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RelaQ04207 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RelaQ04207 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RelaQ04207 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RelaQ04207 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RelaQ04207 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RelaQ04207 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RelaQ04207 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RelaQ04207 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RelaQ04207 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RelaQ04207 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RelaQ04207 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RelaQ04207 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RelaQ04207 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RelaQ04207 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RelaQ04207 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RelaQ04207 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RelaQ04207 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RelaQ04207 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RelaQ04207 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RelaQ04207 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RelaQ04207 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RelaQ04207 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RelaQ04207 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RelaQ04207 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RelaQ04207 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RelaQ04207 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RelaQ04207 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RelaQ04207 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RelaQ04207 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RelaQ04207 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RelaQ04207 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RelaQ04207 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RelaQ04207 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RelaQ04207 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RelaQ04207 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RelaQ04207 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms