Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tff2Q03404 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tff2Q03404 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tff2Q03404 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms