Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Msx2Q03358 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msx2Q03358 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms