Protein–RNA interactions for Protein: Q02956

Prkcz, Protein kinase C zeta type, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkczQ02956 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PrkczQ02956 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms