Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb5Q02739 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms