Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax5Q02650 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms