Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nhlh1Q02576 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nhlh1Q02576 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms