Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Htr1fQ02284 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms