Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ctnnb1Q02248 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ctnnb1Q02248 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms