Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VcpQ01853 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
VcpQ01853 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
VcpQ01853 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
VcpQ01853 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
VcpQ01853 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VcpQ01853 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VcpQ01853 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VcpQ01853 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
VcpQ01853 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms