Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacna1cQ01815 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms