Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HmgcrQ01237 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HmgcrQ01237 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms