Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SeleQ00690 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SeleQ00690 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SeleQ00690 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SeleQ00690 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SeleQ00690 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SeleQ00690 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SeleQ00690 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SeleQ00690 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SeleQ00690 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SeleQ00690 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SeleQ00690 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SeleQ00690 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SeleQ00690 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SeleQ00690 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SeleQ00690 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SeleQ00690 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SeleQ00690 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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