Protein–RNA interactions for Protein: Q00609

Cd80, T-lymphocyte activation antigen CD80, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd80Q00609 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd80Q00609 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd80Q00609 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms