Protein–RNA interactions for Protein: Q00417

Tcf7, Transcription factor 7, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf7Q00417 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcf7Q00417 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcf7Q00417 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcf7Q00417 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcf7Q00417 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcf7Q00417 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcf7Q00417 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcf7Q00417 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcf7Q00417 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tcf7Q00417 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms