Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx2Q00262 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Stx2Q00262 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Stx2Q00262 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Stx2Q00262 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Stx2Q00262 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Stx2Q00262 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Stx2Q00262 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Stx2Q00262 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx2Q00262 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx2Q00262 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx2Q00262 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx2Q00262 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx2Q00262 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx2Q00262 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx2Q00262 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx2Q00262 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx2Q00262 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx2Q00262 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx2Q00262 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx2Q00262 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx2Q00262 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms