Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gbp10Q000W5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbp10Q000W5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbp10Q000W5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbp10Q000W5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbp10Q000W5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbp10Q000W5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbp10Q000W5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbp10Q000W5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbp10Q000W5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbp10Q000W5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbp10Q000W5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbp10Q000W5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbp10Q000W5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbp10Q000W5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbp10Q000W5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp10Q000W5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp10Q000W5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp10Q000W5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp10Q000W5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp10Q000W5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp10Q000W5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp10Q000W5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp10Q000W5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp10Q000W5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbp10Q000W5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbp10Q000W5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbp10Q000W5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbp10Q000W5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbp10Q000W5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbp10Q000W5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbp10Q000W5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms