Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cry1P97784 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cry1P97784 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cry1P97784 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cry1P97784 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cry1P97784 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cry1P97784 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cry1P97784 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cry1P97784 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cry1P97784 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cry1P97784 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cry1P97784 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cry1P97784 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cry1P97784 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cry1P97784 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cry1P97784 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cry1P97784 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms