Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarcc1P97496 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms