Protein–RNA interactions for Protein: P97489

Gata5, Transcription factor GATA-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata5P97489 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gata5P97489 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gata5P97489 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gata5P97489 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Gata5P97489 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gata5P97489 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gata5P97489 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gata5P97489 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms