Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vgll3P85442 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vgll3P85442 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vgll3P85442 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vgll3P85442 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vgll3P85442 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vgll3P85442 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vgll3P85442 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Vgll3P85442 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vgll3P85442 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vgll3P85442 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vgll3P85442 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vgll3P85442 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vgll3P85442 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vgll3P85442 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vgll3P85442 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vgll3P85442 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vgll3P85442 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vgll3P85442 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vgll3P85442 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vgll3P85442 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vgll3P85442 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vgll3P85442 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vgll3P85442 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vgll3P85442 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vgll3P85442 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vgll3P85442 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vgll3P85442 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vgll3P85442 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vgll3P85442 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vgll3P85442 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vgll3P85442 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vgll3P85442 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms