Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx1P81068 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx1P81068 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx1P81068 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx1P81068 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx1P81068 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx1P81068 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx1P81068 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx1P81068 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx1P81068 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx1P81068 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx1P81068 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx1P81068 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx1P81068 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx1P81068 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx1P81068 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx1P81068 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Irx1P81068 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx1P81068 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx1P81068 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx1P81068 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms