Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otx1P80205 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otx1P80205 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otx1P80205 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otx1P80205 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otx1P80205 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otx1P80205 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Otx1P80205 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otx1P80205 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otx1P80205 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms