Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad50P70388 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad50P70388 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad50P70388 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad50P70388 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad50P70388 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rad50P70388 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rad50P70388 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rad50P70388 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rad50P70388 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rad50P70388 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rad50P70388 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rad50P70388 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rad50P70388 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rad50P70388 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rad50P70388 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rad50P70388 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rad50P70388 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rad50P70388 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad50P70388 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad50P70388 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad50P70388 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad50P70388 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad50P70388 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad50P70388 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad50P70388 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad50P70388 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad50P70388 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad50P70388 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad50P70388 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad50P70388 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad50P70388 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad50P70388 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad50P70388 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad50P70388 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad50P70388 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad50P70388 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad50P70388 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad50P70388 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad50P70388 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad50P70388 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad50P70388 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad50P70388 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad50P70388 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad50P70388 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad50P70388 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad50P70388 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad50P70388 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad50P70388 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad50P70388 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad50P70388 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad50P70388 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad50P70388 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad50P70388 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad50P70388 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rad50P70388 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rad50P70388 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rad50P70388 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Rad50P70388 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rad50P70388 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rad50P70388 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rad50P70388 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rad50P70388 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rad50P70388 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rad50P70388 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rad50P70388 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rad50P70388 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rad50P70388 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad50P70388 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad50P70388 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad50P70388 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad50P70388 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad50P70388 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad50P70388 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad50P70388 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad50P70388 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad50P70388 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad50P70388 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad50P70388 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rad50P70388 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rad50P70388 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rad50P70388 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rad50P70388 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rad50P70388 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rad50P70388 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rad50P70388 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rad50P70388 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rad50P70388 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rad50P70388 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rad50P70388 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rad50P70388 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rad50P70388 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rad50P70388 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rad50P70388 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rad50P70388 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rad50P70388 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rad50P70388 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rad50P70388 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rad50P70388 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rad50P70388 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms