Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smad1P70340 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smad1P70340 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smad1P70340 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smad1P70340 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smad1P70340 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smad1P70340 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smad1P70340 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smad1P70340 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smad1P70340 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms