Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tgif1P70284 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tgif1P70284 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tgif1P70284 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tgif1P70284 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tgif1P70284 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tgif1P70284 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tgif1P70284 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tgif1P70284 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tgif1P70284 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tgif1P70284 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tgif1P70284 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tgif1P70284 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tgif1P70284 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tgif1P70284 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tgif1P70284 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tgif1P70284 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tgif1P70284 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tgif1P70284 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tgif1P70284 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tgif1P70284 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tgif1P70284 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms