Protein–RNA interactions for Protein: P70275

Sema3e, Semaphorin-3E, mousemouse

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3eP70275 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sema3eP70275 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema3eP70275 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sema3eP70275 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema3eP70275 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema3eP70275 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema3eP70275 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema3eP70275 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema3eP70275 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Sema3eP70275 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema3eP70275 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema3eP70275 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema3eP70275 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema3eP70275 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sema3eP70275 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema3eP70275 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema3eP70275 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema3eP70275 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sema3eP70275 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sema3eP70275 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sema3eP70275 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sema3eP70275 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sema3eP70275 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sema3eP70275 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sema3eP70275 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sema3eP70275 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sema3eP70275 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sema3eP70275 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sema3eP70275 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sema3eP70275 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sema3eP70275 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sema3eP70275 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sema3eP70275 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sema3eP70275 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sema3eP70275 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sema3eP70275 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sema3eP70275 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sema3eP70275 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sema3eP70275 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sema3eP70275 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sema3eP70275 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sema3eP70275 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sema3eP70275 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sema3eP70275 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Sema3eP70275 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Sema3eP70275 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sema3eP70275 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sema3eP70275 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sema3eP70275 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Sema3eP70275 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sema3eP70275 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sema3eP70275 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sema3eP70275 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sema3eP70275 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sema3eP70275 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sema3eP70275 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sema3eP70275 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sema3eP70275 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sema3eP70275 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sema3eP70275 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sema3eP70275 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sema3eP70275 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sema3eP70275 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sema3eP70275 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sema3eP70275 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sema3eP70275 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sema3eP70275 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sema3eP70275 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sema3eP70275 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sema3eP70275 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sema3eP70275 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sema3eP70275 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sema3eP70275 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sema3eP70275 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sema3eP70275 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sema3eP70275 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sema3eP70275 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sema3eP70275 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema3eP70275 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema3eP70275 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema3eP70275 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema3eP70275 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema3eP70275 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema3eP70275 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema3eP70275 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema3eP70275 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema3eP70275 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema3eP70275 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema3eP70275 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema3eP70275 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema3eP70275 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema3eP70275 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema3eP70275 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema3eP70275 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema3eP70275 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema3eP70275 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema3eP70275 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema3eP70275 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema3eP70275 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema3eP70275 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms