Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrig1P70193 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrig1P70193 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms