Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Traf5P70191 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Traf5P70191 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Traf5P70191 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Traf5P70191 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Traf5P70191 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Traf5P70191 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms