Protein–RNA interactions for Protein: P63260

Actg1, Actin, cytoplasmic 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actg1P63260 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actg1P63260 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actg1P63260 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actg1P63260 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actg1P63260 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actg1P63260 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actg1P63260 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actg1P63260 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actg1P63260 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actg1P63260 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actg1P63260 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actg1P63260 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actg1P63260 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actg1P63260 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actg1P63260 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actg1P63260 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actg1P63260 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Actg1P63260 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Actg1P63260 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Actg1P63260 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms