Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtnP63089 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtnP63089 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtnP63089 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtnP63089 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtnP63089 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtnP63089 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtnP63089 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtnP63089 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtnP63089 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtnP63089 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtnP63089 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtnP63089 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtnP63089 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtnP63089 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PtnP63089 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtnP63089 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtnP63089 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtnP63089 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtnP63089 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtnP63089 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtnP63089 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtnP63089 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PtnP63089 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtnP63089 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtnP63089 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtnP63089 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtnP63089 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtnP63089 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtnP63089 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtnP63089 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtnP63089 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtnP63089 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtnP63089 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtnP63089 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtnP63089 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtnP63089 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtnP63089 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtnP63089 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtnP63089 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtnP63089 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtnP63089 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtnP63089 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtnP63089 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtnP63089 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PtnP63089 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
PtnP63089 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PtnP63089 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtnP63089 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtnP63089 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtnP63089 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtnP63089 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtnP63089 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtnP63089 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PtnP63089 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtnP63089 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtnP63089 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtnP63089 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtnP63089 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtnP63089 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtnP63089 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtnP63089 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtnP63089 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtnP63089 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtnP63089 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtnP63089 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtnP63089 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtnP63089 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtnP63089 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtnP63089 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtnP63089 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtnP63089 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtnP63089 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtnP63089 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtnP63089 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtnP63089 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtnP63089 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtnP63089 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtnP63089 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtnP63089 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtnP63089 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtnP63089 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtnP63089 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtnP63089 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtnP63089 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtnP63089 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtnP63089 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtnP63089 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtnP63089 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtnP63089 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtnP63089 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtnP63089 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtnP63089 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtnP63089 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtnP63089 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtnP63089 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtnP63089 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtnP63089 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtnP63089 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtnP63089 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms