Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gabrb3P63080 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gabrb3P63080 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms