Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra1P62812 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms