Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lmo4P61969 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lmo4P61969 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lmo4P61969 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lmo4P61969 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lmo4P61969 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lmo4P61969 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lmo4P61969 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lmo4P61969 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lmo4P61969 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lmo4P61969 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Lmo4P61969 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lmo4P61969 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lmo4P61969 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lmo4P61969 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lmo4P61969 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lmo4P61969 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lmo4P61969 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Lmo4P61969 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lmo4P61969 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lmo4P61969 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lmo4P61969 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Lmo4P61969 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lmo4P61969 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lmo4P61969 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lmo4P61969 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lmo4P61969 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lmo4P61969 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lmo4P61969 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lmo4P61969 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lmo4P61969 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lmo4P61969 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lmo4P61969 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lmo4P61969 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lmo4P61969 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lmo4P61969 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lmo4P61969 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Lmo4P61969 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lmo4P61969 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lmo4P61969 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Lmo4P61969 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lmo4P61969 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lmo4P61969 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lmo4P61969 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lmo4P61969 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Lmo4P61969 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lmo4P61969 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lmo4P61969 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lmo4P61969 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms