Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ufm1P61961 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ufm1P61961 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ufm1P61961 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms