Protein–RNA interactions for Protein: P61809

Cdk5r1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r1P61809 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdk5r1P61809 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdk5r1P61809 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms