Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Depdc5P61460 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Depdc5P61460 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Depdc5P61460 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Depdc5P61460 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Depdc5P61460 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Depdc5P61460 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Depdc5P61460 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Depdc5P61460 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Depdc5P61460 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Depdc5P61460 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Depdc5P61460 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Depdc5P61460 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Depdc5P61460 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Depdc5P61460 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Depdc5P61460 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Depdc5P61460 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Depdc5P61460 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Depdc5P61460 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Depdc5P61460 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Depdc5P61460 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Depdc5P61460 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Depdc5P61460 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Depdc5P61460 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Depdc5P61460 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Depdc5P61460 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Depdc5P61460 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Depdc5P61460 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Depdc5P61460 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Depdc5P61460 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Depdc5P61460 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Depdc5P61460 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Depdc5P61460 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Depdc5P61460 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Depdc5P61460 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Depdc5P61460 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Depdc5P61460 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Depdc5P61460 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Depdc5P61460 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Depdc5P61460 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Depdc5P61460 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Depdc5P61460 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Depdc5P61460 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Depdc5P61460 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Depdc5P61460 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Depdc5P61460 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Depdc5P61460 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Depdc5P61460 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Depdc5P61460 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Depdc5P61460 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Depdc5P61460 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Depdc5P61460 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Depdc5P61460 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Depdc5P61460 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Depdc5P61460 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Depdc5P61460 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Depdc5P61460 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Depdc5P61460 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Depdc5P61460 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Depdc5P61460 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Depdc5P61460 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Depdc5P61460 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Depdc5P61460 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Depdc5P61460 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Depdc5P61460 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Depdc5P61460 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Depdc5P61460 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Depdc5P61460 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Depdc5P61460 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Depdc5P61460 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Depdc5P61460 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Depdc5P61460 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Depdc5P61460 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Depdc5P61460 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Depdc5P61460 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Depdc5P61460 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Depdc5P61460 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Depdc5P61460 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Depdc5P61460 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Depdc5P61460 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Depdc5P61460 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Depdc5P61460 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Depdc5P61460 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Depdc5P61460 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Depdc5P61460 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Depdc5P61460 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Depdc5P61460 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Depdc5P61460 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Depdc5P61460 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Depdc5P61460 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Depdc5P61460 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Depdc5P61460 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Depdc5P61460 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Depdc5P61460 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Depdc5P61460 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Depdc5P61460 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Depdc5P61460 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Depdc5P61460 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Depdc5P61460 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Depdc5P61460 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms