Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psme3P61290 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psme3P61290 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psme3P61290 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psme3P61290 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Psme3P61290 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psme3P61290 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psme3P61290 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psme3P61290 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psme3P61290 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psme3P61290 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms