Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf13P61216 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf13P61216 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf13P61216 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf13P61216 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf13P61216 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf13P61216 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf13P61216 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf13P61216 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf13P61216 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf13P61216 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf13P61216 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf13P61216 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf13P61216 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf13P61216 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf13P61216 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf13P61216 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf13P61216 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf13P61216 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf13P61216 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf13P61216 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf13P61216 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf13P61216 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf13P61216 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf13P61216 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf13P61216 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf13P61216 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf13P61216 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf13P61216 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf13P61216 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf13P61216 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf13P61216 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf13P61216 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf13P61216 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf13P61216 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf13P61216 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf13P61216 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf13P61216 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf13P61216 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf13P61216 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf13P61216 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf13P61216 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf13P61216 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf13P61216 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf13P61216 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf13P61216 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf13P61216 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf13P61216 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf13P61216 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf13P61216 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf13P61216 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf13P61216 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf13P61216 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf13P61216 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf13P61216 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf13P61216 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf13P61216 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf13P61216 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf13P61216 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf13P61216 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf13P61216 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf13P61216 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf13P61216 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf13P61216 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf13P61216 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf13P61216 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf13P61216 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf13P61216 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf13P61216 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms