Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PlnP61014 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PlnP61014 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PlnP61014 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PlnP61014 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PlnP61014 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PlnP61014 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PlnP61014 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PlnP61014 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PlnP61014 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PlnP61014 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PlnP61014 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PlnP61014 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PlnP61014 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PlnP61014 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PlnP61014 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PlnP61014 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PlnP61014 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PlnP61014 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PlnP61014 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PlnP61014 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PlnP61014 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PlnP61014 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PlnP61014 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PlnP61014 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PlnP61014 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PlnP61014 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PlnP61014 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PlnP61014 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PlnP61014 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PlnP61014 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PlnP61014 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PlnP61014 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PlnP61014 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PlnP61014 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PlnP61014 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PlnP61014 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PlnP61014 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PlnP61014 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PlnP61014 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PlnP61014 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PlnP61014 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PlnP61014 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PlnP61014 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PlnP61014 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PlnP61014 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PlnP61014 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PlnP61014 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PlnP61014 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PlnP61014 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PlnP61014 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PlnP61014 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PlnP61014 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PlnP61014 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PlnP61014 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PlnP61014 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PlnP61014 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PlnP61014 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PlnP61014 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PlnP61014 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PlnP61014 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PlnP61014 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PlnP61014 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PlnP61014 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PlnP61014 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PlnP61014 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PlnP61014 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PlnP61014 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PlnP61014 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PlnP61014 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PlnP61014 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PlnP61014 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PlnP61014 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PlnP61014 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
PlnP61014 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
PlnP61014 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PlnP61014 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PlnP61014 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PlnP61014 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PlnP61014 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PlnP61014 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PlnP61014 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PlnP61014 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PlnP61014 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PlnP61014 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PlnP61014 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PlnP61014 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PlnP61014 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PlnP61014 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PlnP61014 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PlnP61014 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PlnP61014 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PlnP61014 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PlnP61014 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PlnP61014 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PlnP61014 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PlnP61014 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PlnP61014 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PlnP61014 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PlnP61014 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms