Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rin3P59729 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rin3P59729 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rin3P59729 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rin3P59729 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rin3P59729 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rin3P59729 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rin3P59729 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rin3P59729 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rin3P59729 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rin3P59729 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rin3P59729 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rin3P59729 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rin3P59729 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rin3P59729 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rin3P59729 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rin3P59729 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rin3P59729 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rin3P59729 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rin3P59729 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rin3P59729 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rin3P59729 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rin3P59729 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rin3P59729 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rin3P59729 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rin3P59729 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rin3P59729 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rin3P59729 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rin3P59729 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rin3P59729 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rin3P59729 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms