Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Nphp4P59240 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nphp4P59240 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nphp4P59240 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nphp4P59240 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nphp4P59240 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nphp4P59240 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nphp4P59240 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nphp4P59240 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nphp4P59240 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nphp4P59240 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nphp4P59240 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nphp4P59240 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nphp4P59240 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nphp4P59240 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nphp4P59240 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nphp4P59240 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nphp4P59240 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Nphp4P59240 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nphp4P59240 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nphp4P59240 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nphp4P59240 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nphp4P59240 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nphp4P59240 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nphp4P59240 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nphp4P59240 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nphp4P59240 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nphp4P59240 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nphp4P59240 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nphp4P59240 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nphp4P59240 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nphp4P59240 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Nphp4P59240 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nphp4P59240 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nphp4P59240 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nphp4P59240 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nphp4P59240 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nphp4P59240 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nphp4P59240 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nphp4P59240 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nphp4P59240 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nphp4P59240 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Nphp4P59240 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nphp4P59240 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nphp4P59240 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Nphp4P59240 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nphp4P59240 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nphp4P59240 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nphp4P59240 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nphp4P59240 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms