Protein–RNA interactions for Protein: P59110

Senp1, Sentrin-specific protease 1, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp1P59110 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Senp1P59110 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Senp1P59110 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Senp1P59110 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Senp1P59110 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Senp1P59110 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Senp1P59110 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Senp1P59110 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Senp1P59110 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Senp1P59110 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Senp1P59110 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Senp1P59110 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Senp1P59110 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Senp1P59110 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Senp1P59110 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Senp1P59110 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Senp1P59110 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Senp1P59110 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Senp1P59110 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Senp1P59110 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Senp1P59110 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Senp1P59110 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Senp1P59110 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Senp1P59110 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Senp1P59110 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Senp1P59110 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Senp1P59110 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Senp1P59110 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Senp1P59110 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Senp1P59110 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Senp1P59110 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Senp1P59110 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Senp1P59110 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Senp1P59110 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Senp1P59110 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Senp1P59110 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Senp1P59110 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Senp1P59110 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Senp1P59110 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Senp1P59110 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Senp1P59110 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Senp1P59110 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Senp1P59110 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Senp1P59110 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Senp1P59110 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Senp1P59110 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Senp1P59110 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Senp1P59110 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Senp1P59110 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Senp1P59110 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Senp1P59110 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Senp1P59110 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Senp1P59110 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Senp1P59110 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Senp1P59110 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Senp1P59110 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Senp1P59110 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Senp1P59110 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Senp1P59110 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Senp1P59110 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Senp1P59110 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Senp1P59110 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Senp1P59110 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Senp1P59110 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Senp1P59110 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms