Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Csrnp1P59054 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Csrnp1P59054 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csrnp1P59054 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms