Protein–RNA interactions for Protein: P58682

Tlr8, Toll-like receptor 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr8P58682 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tlr8P58682 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tlr8P58682 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tlr8P58682 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tlr8P58682 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tlr8P58682 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tlr8P58682 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tlr8P58682 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tlr8P58682 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tlr8P58682 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tlr8P58682 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tlr8P58682 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tlr8P58682 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tlr8P58682 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tlr8P58682 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tlr8P58682 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tlr8P58682 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Tlr8P58682 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Tlr8P58682 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tlr8P58682 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tlr8P58682 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tlr8P58682 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Tlr8P58682 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tlr8P58682 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tlr8P58682 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tlr8P58682 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tlr8P58682 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tlr8P58682 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tlr8P58682 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tlr8P58682 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tlr8P58682 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms