Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Setd4P58467 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Setd4P58467 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Setd4P58467 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Setd4P58467 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Setd4P58467 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Setd4P58467 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Setd4P58467 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Setd4P58467 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Setd4P58467 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Setd4P58467 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Setd4P58467 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Setd4P58467 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Setd4P58467 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Setd4P58467 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Setd4P58467 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Setd4P58467 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Setd4P58467 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Setd4P58467 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Setd4P58467 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Setd4P58467 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Setd4P58467 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Setd4P58467 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Setd4P58467 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Setd4P58467 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Setd4P58467 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Setd4P58467 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Setd4P58467 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Setd4P58467 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Setd4P58467 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Setd4P58467 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Setd4P58467 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Setd4P58467 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Setd4P58467 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Setd4P58467 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Setd4P58467 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Setd4P58467 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Setd4P58467 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Setd4P58467 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Setd4P58467 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Setd4P58467 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Setd4P58467 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Setd4P58467 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Setd4P58467 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Setd4P58467 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Setd4P58467 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Setd4P58467 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Setd4P58467 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Setd4P58467 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Setd4P58467 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Setd4P58467 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Setd4P58467 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Setd4P58467 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Setd4P58467 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Setd4P58467 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Setd4P58467 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Setd4P58467 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Setd4P58467 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Setd4P58467 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Setd4P58467 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Setd4P58467 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Setd4P58467 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Setd4P58467 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Setd4P58467 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Setd4P58467 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Setd4P58467 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Setd4P58467 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Setd4P58467 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Setd4P58467 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Setd4P58467 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Setd4P58467 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Setd4P58467 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Setd4P58467 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Setd4P58467 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Setd4P58467 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Setd4P58467 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Setd4P58467 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Setd4P58467 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Setd4P58467 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Setd4P58467 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Setd4P58467 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Setd4P58467 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Setd4P58467 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Setd4P58467 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Setd4P58467 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Setd4P58467 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Setd4P58467 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Setd4P58467 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Setd4P58467 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Setd4P58467 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Setd4P58467 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Setd4P58467 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Setd4P58467 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Setd4P58467 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Setd4P58467 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Setd4P58467 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Setd4P58467 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Setd4P58467 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Setd4P58467 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Setd4P58467 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms