Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Snrpa1P57784 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snrpa1P57784 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snrpa1P57784 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snrpa1P57784 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms