Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NcstnP57716 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NcstnP57716 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NcstnP57716 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NcstnP57716 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NcstnP57716 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NcstnP57716 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NcstnP57716 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NcstnP57716 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NcstnP57716 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NcstnP57716 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms