Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gsc2P56916 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gsc2P56916 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.1 ms